Главная

Отчет о работе лаборатории в 2011 году

Электронная версия полного отчета.

В раздел "Учебные пособия" добавлен материал по по курсу "Алгоритмы спектрального анализа с использованием библиотек Intel IPP и MKLА." Н.Панкратов, М.И.Пятков, Р.К.Тетуев, Л.И.Куликова.

Состав лаборатории.

Преподаватели.

  1. Попова Нина Николаевна, к.ф.м.н., доцент - руководитель лаборатории

  2. Ложкин Сергей Андреевич, д. ф.-м. н., профессор.

  3. Гуров Сергей Исаевич, к.ф.м.н., доцент

  4. Панкратов Антон Николаевич, к.ф.м.н., доцент

  5. Сальников Алексей Николаевич, к.ф.м.н., с.н.с.

  6. Марченко Александр Михайлович, д.т.н., профессор.

  7. Романов Дмитрий Сергеевич, к.ф.-м.н., доцент.

  8. Шуплецов Михаил Сергеевич, к.ф.-м.н., м.н.с.

Студенты и аспиранты.

  1. Власов Никита Вадимович, аспирант 3 г/о.

  2. Садовников Олег Александрович, аспирант 2 г/о.

  3. Яблонская (Улесова) Александра Юрьевна, аспирантка 2 г/о.

  4. Данилов Борис Радиславович, аспирант 2 г/о.

  5. Кривошеин Дмитрий Юрьевич, аспирант 1 г/о.

  6. Антюфеев Григорий Валерьевич, аспирант 1 г/о.

  7. Коноводов Владимир Александрович, студент 5 к.

  8. Морозов Евгений Валерьевич, студент 5 к.

  9. Богомолова Евгения Михайловна, студенка 4 к.

  10. Плоткина Юлия Сергеевна, студентка 4 к. (в группе с сентября 2011 года).

  11. Сысоев Никита Олегович, студент 4 к. (в группе с сентября 2011 года).

  12. Снегирев Олег Игоревич (состоял в группе до 30 июня 2011 года как студент 5 к.).

  13. Копачевский Юрий Юрьевич (состоял в группе до 30 июня 2011 года как студент 5 к.).

  14. Жидеханова Назым Даулеткелдиевна (состояла в группе до 30 июня 2011 года
    как студент 5 к.).

  15. Косухин Павел Юрьевич (состоял в группе до 30 июня 2011 года как студент 5 к.).

  16. Андреев Дмитрий Юрьевич, аспирант 2 г.о.

  17. Глазкова Екатерина Алексеевга, аспирантка 2 г.о.

  18. Жарков Александр Валерьевич, аспирант 3 г.о.

  19. Комаров Сергей Александрович, аспирант 3 г.о.

  20. Колесин Максим, студент 5 курса (до 30 июня 2011 г., с октября 2011 – аспирант)

  21. Костин Григорий, студент 4 курса

  22. Романенков Кирилл, студент 4 курса

  23. Бикинеев Артем, студент 5 курса

  24. Доценко Андрей, студент 3 курса

  25. Воробьев Михаил, студент 3 курса

  26. Мозолев Д.С., студент 3 курса

  27. Аванесян С.В., магистрант 1 г.о.

  28. Прокашева О.В. – 5 курс, аспирантка;

  29. Чиркова А.А. – 5 курс, работала с января по июнь 2011 г.;

  30. Марченко Е.А. – 4 курс;

  31. Александров Я.А. – 4 курс.

Основные направления образовательной и научной деятельности.

  1. Суперкомпьютерные технологиии высокопроизводительные вычисления.

  2. Математические модели СБИС.

  3. Интеллектуальный анализ данных: новые задачи и методы

Мероприятия и достижения

Спецкурсы, прочитанные преподавателями лаборатории

  1. «Параллельное программирование для высокопроизводительных вычислительных систем». Лекторы Н.Н.Попова, В.А.Бахтин

  2. «Основы нейросетей» Лектор Д.Ю.Буряк

  3. «Естественные модели параллельных вычислений». Лектор Н.М.Ершов.

  4. «Архитектурные особенности современных вычислительных систем» к.т.н. А. Ф. Мелик-Адамяна .

  5. «Математические модели планарных и клеточных схем» проф. С. А. Ложкин, асс. А. Б. Дайняк, и м. н. с. М. С. Шуплецов .

  6. «Математическая логика» Лектор С.И.Гуров

  7. «Прикладная алгебра». Лектор С.И.Гуров

Научные семинары, проводимые в рамках научных направлений лаборатории

Научная работа лаборатории организовывалась в рамках научных семинаров. Еженедельно проводились заседания следующих научных семинаров:

  1. «Некоторые вопросы синтеза управляющих систем» Научные руководители профессор С. А. Ложкин, доцент Д. С. Романова и м.н.с. А. С. Нагорный

  2. «Теория управляющих систем и математические модели СБИС» Научные руководители - профессор С. А. Ложкин, профессор А. М. Марченко, доцент Д. С. Романов, м. н. с. М. С. Шуплецов.

  3. «Обработка экспериментальных данных с использованием параллельных вычислений, нейросетей и эволюционных вычислений». Научные руководители: чл.корр.РАН Л.Н.Королев, доц. Н.Н.Попова

  4. «Интеллектуальный анализ данных: новые задачи и методы». Научные руководители: доцент С.И.Гуров, доц. А.Н.Панкратов

Основные результаты деятельности лаборатории за отчетный период.

Значительное место в работе лаборатории за отчетный период занимала деятельность по выполнению проекта комиссии Президента РФ «Суперкомпьютерное образование». Преподаватели, студенты и аспиранты организовывали и активно участвовали во всех мероприятиях, проводимых в рамках проекта. С 26 июня по 2 июля 2011 года на базе факультета ВМК, НИВЦ МГУ была проведена летняя молодежная школа “Разработка параллельных приложений для петафлопсных вычислительных систем” (http://school.hpc-russia.ru/).

В подготовке и проведении школы активное участие приняла лаборатория. Особенностью школы стала ее нацеленность на освоение самых передовых технологий разработки сверхмасштабируемых параллельных программ для суперкомпьютерных систем.

Участниками школы стали 24 наиболее подготовленных молодых исследователей – студентов, аспирантов, преподавателей и молодых специалистов из университетов и научных организаций России, прошедших серьезный конкурсный отбор. Среди участников школы были представители из Москвы, Санкт-Петербурга, Белгорода, Петрозаводска, Челябинска, Ставрополя, Владивостока, Ростова на Дону, Уфы, Волгограда, Севастополя. Список участников школы представлен на сайте школы.

Тематика школы:
- Архитектура и программное обеспечение суперкомпьютерных систем: состояние, проблемы, перспективы развития.
- Модели и технологии программирования современных суперкомпьютерных систем, параллельные вычисления.
- Методика разработки и проведения крупномасштабного вычислительного эксперимента в конкретных прикладных областях, практика разработки прикладных параллельных программ.

В образовательной программе школы приняли участие известные российские ученые и сотрудники компаний – лидеров суперкомпьютерной индустрии. Образовательные материалы школы – презентации и видеозапись лекций, представлены на сайте школы (school.hpc-russia.ru). Большое внимание в образовательной программе школы было уделено технологиям Интел. Блок технологий Интел был представлен следующими модулями:

- лекция к. ф.-м. н., доц. ВМК МГУ А. Н. Панкратова « Разработка эффективных параллельных алгоритмов с использованием технологий Интел. Параллельные алгоритмы спектрального анализа».

- лекция Сотрудник Intel Д. Кузьмин « Инструменты Интел для разработки параллельных приложений»,

- лекция сотрудника Intel Д. Сергеева « Введение в инструменты Интел, компилятор — основы векторизации»,

- мастер-класс сотрудника Intel Д. Кузьмина «Инструменты Интел для разработки параллельных приложений».

Материалы лекций, представленные на сайте школы, активно используются в других образовательных программах по суперкомпьютерным технологиям.

Сотрудники, аспиранты и студенты лаборатории приняли активное участие в проведении занятий группы повышения квалификации преподавателей по
суперкомпьютерным технологиям.

Особенностью школы стало выполнение участниками проектов с выходом на высокопроизводительные системы, в том числе на суперкомпьютер «Ломоносов», установленный в МГУ, и высокопроизводительную систему Juropa (пиковая производительность 200 Тфлопс) в суперкомпьютерном центре г.Юлих, Германия. Обе системы построены на базе процессоров Интел. На системах установлено программное обеспечение Интел, поддерживающее технологии разработки параллельных приложений. Эти технологии активно использовались участниками школы при выполнении проектов, что и отмечалось участниками школы на отчетном представлении проектов.

Темы проектов, выполненных участниками школы:

  • Исследование масштабируемости пакета Linpack на вычислительных системах «Ломоносов» и BlueGene/P.

  • Исследованиепроизводительности кода моделирования газовой динамики на суперкомпьютере «Ломоносов».

  • Трехмерное преобразование Фурье: разработка параллельного алгоритма и исследование масштабируемости.

  • Разработка параллельного алгоритма объединения крупноблочных структур (повторов, тандемных повторов) в биопоследовательностях.

  • Проведение тестирования коммуникационной среды суперкомпьютеров с помощью network_tests2 и объединение результатов тестирования.

19 участников летней школы успешно прошли сертификацию по базовым технологиям Интел.

Преподаватели, аспиранты и студенты лаборатории приняли активное участие в проведении обучения группы повышения квалификации профессорско-преподавательского состава в октябре 2011 года. Центральной темой обучения этой группы стала тема разработки приложений для высокопроизводительных систем. 16 преподавателей ВУЗов России прошли обучение в рамках этой группы. Технологии Интел активно изучались в рамках этой программы. Аспирантами лаборатории были подготовлены и проведены специальные занятия по технологиям Интел.

Лаборатория приняла активное участие в организации и проведении обучения специальной группы студентов и аспирантов МГУ по cуперкомпьютерным технологиям в ноябре 2011 г. Учебная программа была посвящена изучению и освоению на практике наиболее востребованных технологий параллельного программирования для суперкомпьютерных систем, параллельных программных прикладных пакетов и инструментальных сред разработки параллельных приложений. Практические работы проводились на высокопроизводительных системах суперкомпьютерного комплекса МГУ «Ломоносов», «Чебышев», BlueGene/P.
Слушатели спецгруппы прошли сертификацию по программе Интел.

Научная работа аспирантов и студентов лаборатории.

  1. Преподаватели и аспиранты лаборатории приняли участие в юбилейных Ломоносовских чтениях, проводимых в МГУ в ноябре 2011 года. В первый день открытия этих чтений была представлена работа: «Исследование масштабируемости спектрального алгоритма распознавания повторов в геномах».
    Доклад доцента Панкратова А.Н., доцента Поповой Н.Н., профессора Дедуса Ф.Ф., ст.науч.сотр. ИМПБ РАН Тетуева Р.К., асп. Пяткова М.И., Асп. Колесина М.С.
    Работа выполнена в рамках лаборатории и демонстрирует собой эффективность нашей работы – работа была мотивирована и инициирована в лаборатории, в работе приняли участие студенты разных кафедр, в работе использованы технологии Интел.

  2. Преподаватели лаборатории Д. С. Романов, А.Н.Панкратов участвовали в конкурсе «Компьютерный континуум: от идеи до воплощения». Тема заявки Д.С.Романова - «Метод синтеза легкотестируемых схем, допускающих единичные проверяющие тесты константной длины». Работа «Информационная система разномасштабного сравнения геномов и изучения гомологий между организмами” (Исполнители: к.ф.-м.н. Панкратов А.Н., к.ф.-м.н. Тетуев Р.К., к.ф.-м.н. Куликова Л.И. стажеры - Пятков М.И., Горчаков М.А., Филиппов В.В.) отмечена дипломом лауреата конкурса прикладных разработок и исследований в области компьютерных технологий “Компьютерный континуум: от идеи до воплощения”, проводимого компанией Интел. (http://ru.intel.com/business/community/index.php?act=computecontinuum&CODE=winners).

  3. Подготовлено учебное пособие в виде лекций, включающих примеры построения вычислительных процедур с исходным кодом на языке программирования C для осуществления спектральных преобразований на основе классических ортогональных многочленов непрерывного аргумента. Учебное пособие содержит оригинальные разработанные авторами алгоритмы вычислений, превосходящие по своим характеристикам аналоги из пакета Numerical Recipes. Материал содержит алгоритмы вычисления ортогональных функций высокого порядка, вычисления нулей ортогональных многочленов, линейной интерполяции, вычисления коэффициентов разложения, суммирования ортогональных рядов. Даны методические указания и примеры по оптимизации указанных процедур с использованием библиотек для высокопроизводительных вычислений Intel IPP и MKL.

  4. Учебный материал был представлен в виде устной лекции «Разработка эффективных параллельных алгоритмов с использованием технологий Интел. Параллельные алгоритмы спектрального анализа» (http://school.hpc-russia.ru/files/materials/osam_hpc.pdf) на летней школе “Разработка параллельных приложений для петафлопсных вычислительных систем” (с 26 июня по 3 июля 2011 года в МГУ имени М. В. Ломоносова на базе НОЦ "Суперкомпьютерные технологии", факультета вычислительной математики и кибернетики и научно-исследовательского вычислительного центра МГУ).

  5. Разработана высокоэффективная векторно-параллельная реализация спектрального алгоритма распознавания повторов в геномах, рассчитанная как на системы с общей памятью, так и на массивно параллельные вычислительные комплексы.

Полученные студентами научные результаты.

  1. В рамках производственной практики студентами 5 курса В. А. Коноводовым и Е. В. Морозовым с использованием суперкомпьютерных технологий строился каталог близких к оптимальных схем контактного типа и схем из функциональных элементов для всех булевых функций от 5 переменных.

  2. В рамках производственной практики студент 5 курса А.Бикинеев провел исследование эффективности реализаций MPI-библиотек для системы «Ломоносов».

  1. Предложена модификация метода О. Б. Лупанова для синтеза схем из функциональных элементов (СФЭ), позволяющая получать схемы той же сложности, что и ранее, но с более равномерным распределением дуг по выходам элементов. Получены асимптотические оценки высокой степени точности (АОВСТ) функции Шеннона для сложности формул стандартного базиса, имеющих ограниченную глубину альтернирования.

  2. Получены новые более точные оценки глубины и формульной сложности мультиплексора в стандартном базисе. В модели задержки СФЭ над произвольным конечным полным базисом, элементы которого допускают произвольное распределение задержки по своим входам, поведение соответствующей функции Шеннона и задержки мультиплексора установлено с точностью до слагаемого вида O(1).

  3. Разработаны методы синтеза оптимальных по сложности схем из предикатных элементов, реализующих предикаты из ненулевых инвариантных классов, которые позволили установить асимптотику соответствующих функций Шеннона для достаточно широкого семейства полных
    предикатных базисов. Аналогичные результаты получены для сложности предикатов из ненулевых классов, связанных с конечно-автоматными языками, причем в ряде базисов для функций Шеннона получены АОВСТ

  4. Получены новые более точные оценки функции Шеннона для размерности гиперкуба, допускающего для любой ФАЛ от заданного числа переменных гомеоморфное вложение реализующей ее СФЭ над стандартным или мультиплексорным базисом, функции Шеннона для площади клеточных СФЭ ограниченной высоты с кратными входами, а также для площади клеточных СФЭ типа via-configurable, являющихся математической моделью некоторых типов СБИС.

  5. Разработан алгоритм пересчета кратчайших путей в графе в случае изменения веса какого-либо ребра. Предложена модификация алгоритма для случая разреженных графов, позволившая существенно понизить оценку его сложности по сравнению с общим случаем. Исследована возможность применения алгоритма в задаче трассировки СБИС.

  6. Найдено точное значение функции Шеннона длины проверяющего теста относительно некоторых типов регистровых сдвигов входов схем.

  7. Установлен порядок функции Шеннона длины проверяющего теста относительно всех перестановок и инвертирующих перестановок входов схем.

  8. Получены нетривиальные оценки функции Шеннона длины проверяющего теста относительно всех циклических сдвигов входов схем.

  9. Получены нетривиальные оценки функций Шеннона длин проверяющего и диагностического теста относительно локальных k-кратных монотонных и локальных k-кратных линейных слипаний входов схем.

  10. Улучшена верхняя оценка функции Шеннона длины проверяющего теста относительно произвольных линейных слипаний входов схем для класса всех булевых функций без несущественных переменных.

  11. Получены точные значения функции Шеннона длины полного диагностического теста относительно замещений веса p для k последовательных нулей в наборе значений переменных в булевых функциях n переменных при выполнении ряда условий для
    n, k, и p, асимптотика функции Шеннона длины полного диагностического теста относительно локальных k-кратных условных замещений переменных в булевых функциях n переменных при n → ∞, k → ∞.

  12. Построен пример полного базиса функциональных элементов, в котором функция Шеннона длины полного проверяющего теста относительно инверсных неисправностей на выходах элементов не превосходит 4.

  13. Построен пример полного базиса функциональных элементов, в котором функция Шеннона длины полного проверяющего теста относительно произвольных константных неисправностей на выходах элементов не превосходит 4.

  14. Доказано, что для произвольного полного базиса функциональных элементов функция Шеннона длины единичного проверяющего теста относительно произвольных константных неисправностей на выходах элементов не превосходит 4.

  15. Построен пример полного базиса функциональных элементов, в котором доля булевых функций n переменных, допускающих реализацию контролепригодной схемой относительно произвольных инверсных неисправностей на выходах элементов, стремится к нулю с ростом n.

  16. Проведен сравнительный анализ параллельных алгоритмов множественного выравнивания белковых последовательностей.

Защищенные дипломные работы

  1. Снегирев О. И. «Оценивание функции Шеннона длины проверяющего теста при перестановках на входах схем».

  2. Копачевский Ю. Ю. «Об оценках длины тестов относительно инвертирующих перестановок переменных».

  3. Жидеханова Н. Д. «Поведение функции Шеннона длины теста при неисправностях специальных типов на входах схем».

  4. Косухин П. Ю. «Проверяющие и диагностические тесты при монотонных слипаниях на входах схем».

Магистерские диссертации

  1. Антюфеев Г. В. «Редукция больших RC-схем».

  2. Кривошеин Д. Ю. «Икрементальный алгоритм поиска кратчайших путей в графе и его применение для задачи трассировки интегральных схем».

Кандидатские диссертации

  1. Шуплецов Михаил Сергеевич «Методы синтеза и оценки сложности схем, построенных из элементов предикатного типа» (22 апреля 2011 г., Диссертационный совет Д 501.001.44 в Московском государственном университете имени М. В.Ломоносова).

Участие в научных конференциях в 2011 году

  1. XVI Международная конференция «Проблемы теоретической кибернетики» (Нижний Новгород, 20-25 июня 2011 года) – 9 участников, 9 секционных докладов.

  2. Математические методы распознавания образов: 15-я Всероссийская конференция, г.Петрозаводск, 11-17 сентября 2011 г.

  3. Научный сервис в сети Интернет: экзафлопсное будущее: Труды Международной суперкомпьютерной конференции (19-24 сентября 2011 г., г. Новороссийск)

  4. Международный научный форум «Казахстан и евразийская идея в новом мире» (Казахстан, Астана, 24-26 октября 2011 года) – 1 участник, 2 секционных доклада.

  5. Ломоносовские чтения: Научная конференция, посвященная 300-летию со дня рождения М.В.Ломоносова: Москва, факультет ВМК МГУ имени М.В.Ломоносова, 14-23 ноября 2011 г

  6. Восьмая молодежная научная школа по дискретной математике и ее приложениям (Москва, ИПМ имени М. В. Келдыша, 24-29 октября 2011 года) – 3 участника, 3 секционных доклада.

  7. Динамические системы, нелинейный анализ и приложения», Республика Армения и НКР, гг. Ереван, Степанакерт, 10 - 17 июля 2011

  8. Крымская осенняя математическая школа-симпозиум (КРОМШ-2011). Украина, АРК, г. Севастополь, пос. Ласпи, 18 - 29 сентября 2011 г.

  9. Second Regional Conference “Supercomputing Applications in Science and Industry” in Sunny Beach, Black Sea Coast Bulgaria on September 20-21, 2011.

  10. 7-th Moscow conference on computational molecular biology, Moscow, Russia, July 21-24, 2011,

Публикации 2011 года

1. Н.Л. Григоренко, А.В. Жарков, Д.Г. Пивовартчук, Н.Н. Попова Разработка и исследование параллельного алгоритма оптимизации развития динамической транспортной сети //( Параллельные вычислительные технологии (ПаВТ’2011): труды международной научной конференции (Москва, 28 марта – 1 апреля 2011 г.) [Электронный ресурс] – Челябинск: Издательский центр ЮУрГУ, 2011. – с. 681. ISBN 978-5-696-04090-5
2. Н.Л. Григоренко, А.В. Жарков, Д.Г. Пивовартчук, Н.Н. Попова Параллельный алгоритм оптимизации развития транспортной сети на основе алгоритма Эдмонса-Карпа. // Труды международной конференции Научный сервис в сети Интернет, Россия, Новороссийск, –М.: Изд-во МГУ, 2011, СС.
3. 4. Н.Л. Григоренко, А.В. Жарков, Д.Г. Пивовартчук, Н.Н. Попова Исследование эффективности решения задачи оптимального развития транспортной сети с непрерывным потоком на суперкомпьютерах. // Ломоносовские чтения, 2011

5. V.V.Voevodin , V.P Gergel,L.B.Sokolinsky ,V.P.Demkin , N.N.Popova , L.V.Bukhanovsky Supercomputing educational project of the leading Russian universities.//Advances in Intelligent and Soft Computing, Vol. 127 ISBN 978-3-642-25907-4
6. V.V.Voevodin, N.N.Popova,V.P.Gergel,L.B.Sokolinsky ,V.P.Demkin, L.V.Bukhanovsky Supercomputing education system of the Russian universities.// Proceedings of the Second Regional Conference “Supercomputing Applications in Science and Industry” in Sunny Beach, Black Sea Coast Bulgaria on September 20-21, 2011.
7. Морозов Е.В., Романов Д.С. О тестах относительно локальных линейных слипаний входов схем // Проблемы теоретической кибернетики. Материалы XVI Международной конференции (Нижний Новгород, 20-25 июня 2011 года). Нижний Новгород: Издательство Нижегородского университета, 2011. С. 330-334.
8. Романов Д.С. О синтезе схем, допускающих проверяющие тесты константной длины // Проблемы теоретической кибернетики. Материалы XVI Международной конференции (Нижний Новгород, 20-25 июня 2011 года). Нижний Новгород: Издательство Нижегородского университета, 2011. С. 400-403.
9. Садовников О.А. Уточненные оценки функции Шеннона в некоторых базисах схем из функциональных элементов, вложенных в единичный куб // Проблемы теоретической кибернетики. Материалы XVI Международной конференции (Нижний Новгород, 20-25 июня 2011 года). Нижний Новгород: Издательство Нижегородского университета, 2011. С. 412-415.
10. Улесова А.Ю. О сложности односторонних клеточных схем фиксированной высоты с кратными входами // Проблемы теоретической кибернетики. Материалы XVI Международной конференции (Нижний Новгород, 20-25 июня 2011 года). Нижний Новгород: Издательство Нижегородского университета, 2011. С. 487-491.
11. Власов Н.В. О сложности мультиплексорной функции в классе формул // Проблемы теоретической кибернетики. Материалы XVI Международной конференции (Нижний Новгород, 20-25 июня 2011 года). Нижний Новгород: Издательство Нижегородского университета, 2011. С. 96-97.
12. Шуплецов М.С. О сложности реализации предикатов из некоторых классов предикатными схемами // Проблемы теоретической кибернетики. Материалы XVI Международной конференции (Нижний Новгород, 20-25 июня 2011 г.) Под редакцией Ю.И. Журавлева. Нижний Новгород: Изд-во Нижегородского госуниверситета, 2011. С. 573-577.
13. Ложкин С.А., Данилов Б.Р. Поведение функции Шеннона для задержки в одной модели схем из функциональных элементов // Проблемы теоретической кибернетики. Материалы XVI Международной конференции (Нижний Новгород, 20-25 июня 2011 года). Нижний Новгород: Издательство Нижегородского университета, 2011. С. 277-280.
14. Ложкин С.А., Коноводов В.А. О синтезе и сложности формул с ограниченной глубиной альтернирования // Проблемы теоретической кибернетики. Материалы XVI Международной конференции (Нижний Новгород, 20-25 июня 2011 года). Нижний Новгород: Издательство Нижегородского университета, 2011. С. 281-284.
15. Романов Д.С. О проверяющих тестах относительно перестановок переменных в булевых функциях // Проблемы теоретической кибернетики. Материалы XVI Международной конференции (Нижний Новгород, 20-25 июня 2011 года). Нижний Новгород: Издательство Нижегородского университета, 2011. С. 396-399.
16. Ложкин С.А., Власов Н.В. О глубине мультиплексорной функции // Вестн. моск. ун-та. Серия 15. Вычисл. матем. и киберн. 2011, № 2. С. 40-46.
17.Ложкин С.А., Данилов Б.Р. О задержке схем из функциональных элементов в модели с произвольным распределением задержек элементов базиса по входам // Прикладная математика и информатика. № 39. М.: Изд-во факультета ВМК МГУ, 2011. С. 107-125.

18. Устинин М.Н., Поликарпов М.А., Панкратов А.Н., Рыкунов С.Д., Наурзаков С.П., Гребенкин А.П., Панченко В.Я. Сравнительный анализ экспериментальных данных магнитной энцефалографии //Математическая биология и биоинформатика. 2011. Т. 6. № 1. С. 63-70. URL: http://www.matbio.org/2011/Ustinin2011(6_63).pdf
19. Устинин М.Н., Панкратова Н.М. Нахождение опорных точек в данных магнитной энцефалографии// Математические методы распознавания образов: 15-я Всероссийская конференция, г.Петрозаводск, 11-17 сентября 2011 г.: Сборник докладов – М.: МАКС Пресс, 2011, с. 501-502
20. Горчаков М.А., Панкратов А.Н. О методе оценки качества поиска повторов в генетических последовательностях// Математические методы распознавания образов: 15-я Всероссийская конференция, г.Петрозаводск, 11-17 сентября 2011 г.: Сборник докладов – М.: МАКС Пресс, 2011, c. 522-524
21. Панкратов А.Н., Пятков М.И. О спектральном алгоритме распознавания протяженных тандемных повторов в геноме // Математические методы распознавания образов: 15-я Всероссийская конференция, г.Петрозаводск, 11-17 сентября 2011 г.: Сборник докладов – М.: МАКС Пресс, 2011, с. 525-528
22. Дедус Ф.Ф., Тетуев Р.К., Назипова Н.Н., Ольшевец М.М., Панкратов А.Н., Пятков М.И. Преимущество оценок подобия ДНК с помощью спектрально-аналитического метода// Математические методы распознавания образов: 15-я Всероссийская конференция, г.Петрозаводск, 11-17 сентября 2011 г.: Сборник докладов – М.: МАКС Пресс, 2011, с.529-531
23. Панкратов А.Н., Пятков М.И., Комаров С.А., Колесин М.С., Попова Н.Н. Распараллеливание спектрального алгоритма поиска повторов в геномах// Научный сервис в сети Интернет: экзафлопсное будущее: Труды Международной суперкомпьютерной конференции (19-24 сентября 2011 г., г. Новороссийск) – М.: Издательство МГУ, 2011, с.304-306
24. Панкратов А.Н., Тетуев Р.К., Комаров С.А., Колесин М.С., Попова Н.Н., Пятков М.И., Дедус Ф.Ф. Исследование масштабируемости спектрального алгоритма распознавания повторов в геномах// Ломоносовские чтения: Научная конференция, посвященная 300-летию со дня рождения М.В.Ломоносова: Москва, факультет ВМК МГУ имени М.В.Ломоносова, 14-23 ноября 2011 г.: Тезисы докладов – М.: Издательский отдел факультета ВМиК МГУ имени М.В.Ломоносова, 2011, c.26-27
25. S. Gurov. Статистическая модель оценки надёжности алгоритмов классификации печ. Spectral and Evolution Problems (International scientific journal). Международный научный журнал. Vol. 21. Issue 21. Simferopol: Taurida National V. Vernadsky University. – 2011. С. 88-91.
26. А.А. Онищенко, С.И. Гуров. Классификация на основе АФП и бикларизации: возможности подхода / Прикладная математика и информатика: Труды факультета Вычислительной математики и кибернетики. № 38. М.: Изд-во факультета ВМК МГУ, 2011. С. 77-87. М.: МАКС Пресс, 2011. № 38. С. 77-87.
27. С.И. Гуров. Оценка надёжности алгоритма классификации на основе новой информационной модели // Журнал вычислительной математики и математической физики, 2011 (в печати).
28. С.И. Гуров. Характеристики частично упорядоченных множеств и проблема Ногина / Динамические системы, нелинейный анализ и их приложения. Материалы международной конфференции, г. Ереван, 10- 17 июля 2011 г. – М.: ЦЭМИ РАН, 2011 – С. 47-49.
29. С.И. Гуров. О параметрах некоторых частично упорядоченных множеств / Математические методы распознавания образов: 15-я Всероссийская конференция. Республика Карелия, Петрозаводск, 11-17 сентября 2011 г.: Сборник докладов. – М.: МАКС Пресс, 2011. – С. 309-312.
30. А.А. Онищенко, С.И. Гуров. Эффективность анализа формальных понятий в задачах классификации / Крымская Осенняя Математическая Школа (КРОМШ-2011). Crimea, Laspi-Batiliman, September 17-29. Сборник тезисов. С. 15-16.
31. А.А. Онищенко, С.И. Гуров. Эффективность АФП в задачах распознавания // Spectral and Evolution Problems (International scientific journal). Vol.23. Simferopol: Taurida National V. Vernadsky University. – 2012 (в печати).
32. С.И. Гуров. Упорядоченные множества и алгебраические системы / М.: МАКС Пресс, 2011 (в печати).
33. К. Леонтьев, Я.А.Александров, С.И. Гуров, П.Л. Гутеев. Обзор методов обработки биометрической информации для задач защиты и аутентификакции персональных данных. Отчёт по НИР «МАЯК – 2» (этап 2). – М.: ВЦ РАН, МГУ им. М. В. Ломоносова, ф-т ВМиК: 2011. 42 с.
34. Андреев Д.Ю., Костин Г.А., Сальников А.Н., Майсурадзе А.И. «Исследование алгоритмов кластеризации для анализа результатов тестирования коммуникационной среды многопроцессорных систем» // Научный сервис в сети Интернет: экзафлопсное будущее: Труды Международной суперкомпьютерной конференции (19-24 сентября 2011 г., г. Новороссийск). - М.: Изд-во МГУ, 2011. - 104-111 с. ISBN 978-5-211-06229-0
35. Kirill V. Romanenkov, Alexey N. Salnikov Comparison of quality and performance of parallel algorithms for Multiply Sequence Alignment // Proceedings of the 7-th Moscow conference on computational molecular biology, Moscow, Russia, July 21-24, 2011, pp. 318-319.
36. Alexey Salnikov, Dmitry Andreev, Roman Lebedev The Analysis of Cluster Interconnect with the Network_Tests2 Toolkit // Lecture Notes in Computer Science (LNCS 6960) Recent Advances in the Message Passing Interface, Volume 6960, Springer Berlin / Heidelberg, 2011, pp. 160-169, ISBN: 978-3-642-24448-3, [url:http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-24449-0_19 ].

Отчет подготовлен Н.Н.Поповой.

Использованы материалы отчетов,
представленных:

Д.С.Романовым, С.И.Гуровым, А.Н.Панкратовым,
А.Н.Сальниковым.